腸活で睡眠の質は変わる？腸の検査がすすめた食べものと、やめた早寝
「腸活は睡眠にもいいらしい」。そう聞いて、ヤクルト1000のような乳酸菌飲料を手に取ったことはありませんか？
でも、ネットの質問サイトを見ると、「よく眠れるようになった」という人もいれば、「あまり変わらなかった」という人もいます。同じものを飲んでいるのに、どうして違うのでしょう。
私も、「朝からなんとなく体が重い」のは寝不足のせい。自分はロングスリーパーなんだ——そう思って、とにかく早く寝ることを頑張っていました。
ところが、自宅でできる腸の検査を受けたら、睡眠に関わる点数が、日本人平均の約半分。生まれつきの体質を調べる遺伝子検査でも、「睡眠の質が低くなりやすい」と出ました。
そこで私は、早寝早起きをやめました。そして、「腸の検査ですすめられた食べもの」を、毎日の食事に足しています。
この記事でわかること
- 腸と睡眠は、どう関係しているのか
- 乳酸菌飲料で眠りが変わる人・変わらない人がいる理由
- 腸の検査がすすめた「自分に合う、睡眠のための食べもの」
- 早寝早起きをやめて、変わったこと
乳酸菌飲料が、合う人と合わへん人がいるニャ？
そうやで。人によって「腸に合う食材」は違うんやで
腸活で睡眠の質は変わる？腸と睡眠の関係をやさしく解説
「腸と睡眠って、本当に関係あるの？」と思いますよね。私も最初は疑問でした。
実は、腸と脳はお互いに影響し合っていることが分かってきています（筑波大学）。「脳腸相関（のうちょうそうかん）」と呼ばれる考え方です。
腸内細菌がいなくなると、睡眠のリズムが乱れた（マウスの研究）
筑波大学などの研究グループは、薬で腸内細菌をいなくしたマウスの睡眠を調べました。すると、本来眠る時間帯の睡眠が減り、活動する時間帯の睡眠が増えて、昼と夜のメリハリが弱くなっていました。腸の中では、神経の働きを整えるセロトニンも作られなくなっていたそうです（筑波大学 2020年）。
ただし、これはマウスの研究です。人でも同じことが言えるのか、どの菌が眠りにどう関わるのかは、まだ研究の途中です。
結論：関係はありそう。では腸活すればいいの？
腸と睡眠は、関係していそうです。でも、「これを食べれば誰でもぐっすり眠れる」というほど単純な話ではありません。
そして、ここで大事になるのが「人によって、腸の中身（腸内フローラ）がちがう」ということです。
一人一人、腸の中身がちがうニャ？
腸の中身がちがうから、合う合わないがあるニャン
乳酸菌飲料で眠りが変わる人・変わらない人がいるのはなぜ？
「腸活 睡眠」で調べると、たくさんの乳酸菌飲料やサプリが出てきます。よく名前を聞くのが、ヤクルト1000や「PLUSカルピス 睡眠・腸活ケア」です。
ネットの質問サイトには、こんな相談がたくさん並んでいます。
- 飲み始めてから、目覚めがよくなった
- 早く目が覚めすぎるようになった
- しばらく飲んだけれど、あまり変わらなかった
- いつ飲めばいいの？
同じものを飲んでいるのに、感じ方がこれだけちがう。理由として考えられることを2つ挙げます。
理由①届け出られている「はたらき」には、ストレスがセットで書かれている
どちらも「機能性表示食品」です。会社が科学的な根拠を消費者庁に届け出て、決められた表示をしている食品で、トクホとちがって国が審査したものではありません（消費者庁）。
| 商品 | 入っている菌 | 表示されているはたらき |
|---|---|---|
| Yakult（ヤクルト）1000 | 乳酸菌 シロタ株 | 一時的な精神的ストレスがかかる状況でのストレスをやわらげ、睡眠の質（眠りの深さ、すっきりとした目覚め）を高める。腸内環境を改善する機能も報告されている |
| PLUSカルピス 睡眠・腸活ケア | ガセリ菌CP2305株 | 心理的なストレスを和らげ、睡眠の質（眠りの深さ）を高める機能、腸内環境を整える機能が報告されている |
どちらも、睡眠の質とストレスがセットで書かれています。眠りの悩みの原因は、人によってちがいます。原因がちがえば、合うものがちがうのも自然なことです。
眠りの悩みの原因は、ストレスだけじゃないニャン
理由②腸の中の菌の種類は、人によって大きくちがう
もうひとつは、腸内細菌の種類が人それぞれちがうことです。もともと腸にいる菌がちがえば、同じ菌を取り入れても、腸の中で起きる変化もちがうかもしれません。
私は3年前から「腸内フローラ検査」を続けていますが、同じように食事を変えても、すぐ変わる菌と、変わらない菌がありました。
「何を飲めば眠れるか」を探す前に、いまの自分の腸を確かめる。それが近道です。
「自分の腸に合う食材」を、調べる方法があるニャン？
検査したら教えてくれるニャ。検査は2種類あるニャン
腸内フローラ検査と遺伝子検査｜それぞれの睡眠カテゴリーの結果
私の結果は、2つとも睡眠に注意が出ていました。朝がつらい、なんとなくだるい。その理由を考えるヒントになる結果でした。
2つの検査をかんたんに説明してから、私の結果をお見せします。
腸内フローラ検査：変えられる自分…いまの生活習慣や食事によって決まる
遺伝子検査：変わらない自分…もともとの体質
腸内フローラ検査｜いまの自分を知る
1つ目は、腸内フローラ検査「chatFLORA G（チャットフローラG）」です。便を少しだけ採って送ると、腸にどんな菌がどれくらいいるかを調べてくれます。結果は、睡眠をふくむ8つの分野ごとに、日本人の平均と比べた点数で出ます。
実際の睡眠の分野の結果がこちらです。
| 項目 | 私 | 日本人の平均 | 見方 |
|---|---|---|---|
| 睡眠の質 | 24.4点 | 47.6点 | 睡眠の質に関わるとされる菌の点数。高いほどよい |
| 夜中に目が覚めやすい傾向 | 73.4点 | 65.4点 | 夜中に目が覚めやすい人に多い菌の点数。高いほど注意 |
睡眠の質は、平均の約半分。夜中に目が覚めやすい傾向は、平均より高め。気をつけて睡眠時間を確保していたのに、ショックな結果でした。
遺伝子検査｜生まれつきの体質を知る
2つ目は、唾液で生まれつきの体質の傾向を調べる遺伝子検査「chatGENE Pro（チャットジーン プロ）」です。こちらも実際の睡眠の結果です。
| 項目 | 私の結果 | メモ |
|---|---|---|
| 睡眠の質 | 低くなりやすい | この判定が出るのは日本人の13% |
| 朝型・夜型 | 夜型 | 日本人の49%が夜型 |
| ショートスリーパー | 傾向あり | 「短くても平気」ではなく「短くなりがち」 |
| 睡眠の深さ | 標準 |
生まれつきの体質（遺伝子検査）と、今の腸の状態（腸内フローラ検査）。2つの検査が、どちらも睡眠に黄色信号を出していました。
大切なこと
どちらの検査も、病気の診断ではありません。chatFLORA Gの点数は、菌の量から見た「関わり」の目安で、眠りの病気を判定するものではありません。遺伝子検査で分かるのも、「なりやすい傾向」です。
日中に眠くなる。朝起きるのがつらい。だから私は、自分はロングスリーパーなんだと思っていました。長く眠れば朝はすっきり起きられるし、昼間に睡魔に襲われることもないはず——そう信じていたんです。ところが結果は、足りないのは量ではなく質。しかも夜型。これには驚きました。
この2つの検査結果から、「腸から睡眠を見直す」ことにしました。遺伝子は一生変わりませんが、腸の中身は、食べるものや暮らし方で変わっていくからです。
いまの自分が知れる『腸内フローラ検査』の、申し込みから結果が届くまでの流れはこちらから
▶ チャットフローラGをやってみた｜腸活3年目のリアルな結果と口コミ
自分のなりやすい傾向を知ることができる『遺伝子検査』の、申し込みから結果が届くまでの流れはこちらから
▶ チャットジーン プロをやってみた｜親子で受けた500項目の結果と口コミ
早寝早起きをやめた｜眠くなるまで起きて、起きる時間は変えない
結果を見て、私がまず変えたのは寝る時間です。
それまでは「明日も早いから」と、眠くなくても早めに布団に入っていました。今は、眠くなるまで起きています。それでも、朝はこれまでと同じ時間に目が覚めます。
睡眠を見直してから約4か月。変わったことは3つあります。
- 夜に集中して作業できるようになった
- 眠くなった瞬間を逃さず布団に入るので、夜中に目が覚めなくなった
- 目覚ましが鳴る数分前に自然と目が覚める日が増え、前よりすっきり起きられる
厚生労働省のガイドも「眠気が来てから寝床へ」
あとで調べてみると、厚生労働省の「健康づくりのための睡眠ガイド2023」にも、無理に寝ようとせず、眠気が来てから寝床に入ると寝つきやすくなる、と書かれていました。
その前の「健康づくりのための睡眠指針2014」にも、「眠くなってから寝床に入り、起きる時刻は遅らせない」という項目があります。眠ろうと意気込むほど頭がさえて、かえって寝つけなくなるからだそうです。
私の遺伝子は「夜型」で「睡眠が短くなりがち」。眠くないのに早く布団に入っても眠れないのは、ある意味あたりまえだったのかもしれません。
ただし、これは私の場合です。私はいま、毎日6時間ほど眠れています。厚生労働省は、大人は6時間以上の睡眠を目安にすることをすすめています（Good Sleepガイド）。寝る時間が遅くなって睡眠が足りなくなるなら、本末転倒です。
ちなみに、夜に飲むコーヒーも疑っていたのですが、遺伝子で調べたら、カフェインの影響を受けにくいタイプでした。
▶ カフェインで眠れないのは体質？遺伝子で調べたらコーヒーのせいじゃなかった
睡眠は「量より質」のタイプやったニャ
次の腸内フローラ検査で、点数がよくなってるかもニャ
腸の検査がすすめた「睡眠の質」のための食べもの｜私がいま食べているもの
腸内フローラ検査の『chatFLORA G』の結果には、「腸活のススメ」という、私の腸に合わせた食べものや習慣の提案がついてきます。睡眠の分野で出てきたのは、こんなものでした。
| 目的 | すすめられたもの |
|---|---|
| 睡眠の質 | 大豆・納豆・レジスタントスターチ（消化されにくいでんぷん）・ビーガン料理・ランニング |
| 夜中に目が覚めやすい傾向 | えごま油・亜麻仁油・α-リノレン酸・ガラクトオリゴ糖・定期的な運動 |
この食べものの提案は、検査の結果と食生活アンケートを組み合わせて、すでにふだん食べているものは重ねてすすめず、まだ十分に取り入れていない食べものを出す仕組みだそうです（KEAN Health 2026年）。私の結果に乳酸菌やヨーグルトが出てこなかったのも、そのためかもしれません。
えごま油と亜麻仁油は、遺伝子検査でも「足りなくなりやすい」と出ていた
えごま油や亜麻仁油に多いα-リノレン酸は、オメガ3と呼ばれる脂肪酸の仲間です。そして私の遺伝子検査では、オメガ3が「不足しやすい」という結果でした。
腸の検査と遺伝子の検査。別々の検査が、同じものを指していたんです。2つを受けていちばん「これか！」と思ったのが、ここでした。
私がいま食べているもの
朝ごはんに豆乳きなこ。アマニ油（亜麻仁油）は、どんなメニューにも数滴たらしています。
これは私の腸の検査がすすめたもので、「これを食べれば眠れる」というものではありません。合う食べものは人によってちがうので、気になる人は自分の腸を調べてから選ぶのがおすすめです。
正直に書くと、いま感じている眠りの変化は、まず寝る時間を変えたことによるものだと思います。腸活の効果は、次の検査で睡眠の点数がどう変わるかで確かめます。結果が出たら、この記事に追記します。
腸から睡眠を見直すのが向いている人・向いていない人
向いていない人（先に医療機関へ）
- 眠れない日が長く続いている人、昼間の生活に支障が出ている人
- 大きないびきや、寝ているときに呼吸が止まると言われた人
- 1回の検査で、すべてが分かると思っている人
向いている人
- 乳酸菌飲料を試したけれど、ピンとこなかった人
- 腸活をしているのに、眠りが変わらない人
- 何を食べればいいか、情報が多すぎて迷っている人
- 早く寝ても、朝がつらい人
自分に合う腸活を知るには｜腸内フローラ検査で「睡眠」を見る
自分の腸を知るには、腸内フローラ検査を受けるのが近道です。私が受けたchatFLORA Gは、こんな検査でした。
- 自宅で便を少し採って、郵送するだけ
- 睡眠をふくむ8つの分野で、日本人の平均と比べた点数が出る
- 「腸活のススメ」で、自分の腸に合わせた食べものの提案がある
- 菌を細かいレベル（種）まで見てくれる
- 運営は日本のKEAN Health（遺伝子検査chatGENEと同じ会社）
実際の結果画面や、申し込みから結果が届くまでの日数は、こちらで全部見せています。
▶ チャットフローラGをやってみた｜腸活3年目のリアルな結果と口コミ
ほかの腸内フローラ検査と比べてから選びたい人は、こちらで比較しています。
▶ 自宅でできる腸内フローラ検査キット おすすめ比較【2026年】
生まれつきの睡眠の体質（夜型・ショートスリーパーなど）も知りたい人は、遺伝子検査の記事をどうぞ。
▶ チャットジーン プロをやってみた｜親子で受けた500項目の結果と口コミ
次の検査で、睡眠の点数はどう変わるのか。睡眠の質は上がっているのか。いまから楽しみです。
腸活と睡眠のよくある質問
Q. 腸活で睡眠の質は本当に上がりますか？
A. 腸と睡眠の関係は研究が進んでいますが、「腸活をすれば誰でもよく眠れる」とはまだ言えません。合う食べものも人によってちがいます。私は自分の腸の結果を見て、食べるものを選ぶことにしました。
Q. 腸内環境がよくなると眠くなるのはなぜですか？
A. はっきりした仕組みは、まだ研究の途中です。腸と脳はお互いに影響し合っていると考えられていて、マウスの研究では、腸内細菌がいなくなると睡眠のリズムが乱れることが分かっています（筑波大学 2020年）。
Q. 睡眠不足だと、腸内環境も悪くなりますか？
A. 関係があると考えられています。健康な大人を調べた北海道大学の研究では、睡眠時間が短い人ほど、腸を守る物質（αディフェンシン）が少なく、腸内細菌のバランスの乱れや、酪酸などの量の低下と関わっていたと報告されています（北海道大学 2023年）。
Q. ヤクルト1000などの乳酸菌飲料は、いつ飲むのがいいですか？
A. ヤクルト1000もPLUSカルピス 睡眠・腸活ケアも、商品ページの表示は「1日1本が目安」で、飲む時間の指定はありません（2026年10月時点）。気になる場合は、商品の表示やメーカーの案内を確認してください。
Q. 腸内フローラ検査で、睡眠の何が分かりますか？
A. chatFLORA Gでは、「睡眠の質」と「夜中に目が覚めやすい傾向」に関わるとされる菌の量を、点数で見ることができます。病気の診断ではありません。
Q. 睡眠の点数が低かったら、眠りの病気ですか？
A. いいえ。点数は菌の量から見た目安で、研究の途中の部分もあります。眠れない日が続くなど気になる症状があるときは、検査の点数より先に医療機関に相談してください。
Q. 早寝早起きは、やめたほうがいいですか？
A. 私は「眠くなってから寝る・起きる時間は変えない」にして、寝つきが早くなりました（私の場合です）。厚生労働省の睡眠ガイドも、無理に寝ようとせず、眠気が来てから寝床に入ることをすすめています。ただし大人は6時間以上の睡眠が目安なので、睡眠時間が足りなくならないように気をつけてください。
Q. 遺伝子検査でも、睡眠のことは分かりますか？
A. 分かるのは、生まれつきの「傾向」です。私の場合は、睡眠の質・朝型か夜型か・ショートスリーパーかどうかなどが分かりました。カフェインの影響の受けやすさも調べられます。
▶ カフェインで眠れないのは体質？遺伝子で調べたらコーヒーのせいじゃなかった
まとめ：眠りの腸活は「自分の腸を見てから」選ぶ
- 腸と睡眠は関係していそう。でも「これを飲めば眠れる」とは、まだ言えない
- 同じ乳酸菌飲料でも、合う人・合わない人がいる
- 私の腸は、睡眠の点数が平均の約半分。遺伝子でも「睡眠の質が低くなりやすい」だった
- 早寝早起きをやめて、眠くなってから寝るようにした
- 腸の検査がすすめた食べもの（大豆・納豆・えごま油など）を食べて、次の検査で答え合わせをする
何を飲むか、何を食べるかを決める前に、まず自分の腸を見る。これが、腸活3年目の私がたどり着いた「眠りの腸活」です。
▶ チャットフローラGをやってみた｜腸活3年目のリアルな結果と口コミ
眠りの悩みは、毎日の元気に直結します。「眠りを変えたい」と思っているあなたの、小さなきっかけになればうれしいです。
「自分に合う食材」を取り入れたら、腸内フローラ検査の点数は良くなったのか。結果は追記するから、また見に来てな
※この記事は、私個人の検査結果と体験です。腸内フローラ検査・遺伝子検査は、医学的な診断ではありません。眠れない日が続くなど気になる症状がある方は、自己判断せず医療機関にご相談ください。
参考にした資料
- 厚生労働省「健康づくりのための睡眠ガイド2023」
- 厚生労働省「健康づくりのための睡眠指針2014」
- 厚生労働省「Good Sleepガイド（成人版）」
- 筑波大学「腸内細菌がいなくなると睡眠パターンが乱れる」（2020年）
- 北海道大学「睡眠不足が腸内細菌叢を乱すメカニズムを初めて解明」（2023年）
- 消費者庁「機能性表示食品について」
- ヤクルト本社「Yakult（ヤクルト）1000 商品情報」
- アサヒ飲料「PLUSカルピス 睡眠・腸活ケア 商品情報」
- KEAN Health「腸内フローラと食生活に基づく食品提案技術で特許取得」（2026年・PR TIMES）
